| Thị trấn Đoan Hùng | Xã Đoan Hùng |
| Xã Bằng Doãn | Xã Bằng Luân |
| Xã Bằng Luân | Xã Bằng Luân |
| Xã Ca Đình | Xã Tây Cốc |
| Xã Chân Mộng | Xã Chân Mộng |
| Xã Chí Đám | Xã Chí Đám |
| Xã Đại Nghĩa (đã nhập từ 01/01/2020) | Xã Đoan Hùng |
| Xã Đông Khê (đã nhập từ 01/01/2020) | Xã Chí Đám |
| Xã Hợp Nhất | Xã Đoan Hùng |
| Xã Hùng Long | Xã Chân Mộng |
| Xã Hùng Quan (đã nhập từ 01/01/2020) | Xã Chí Đám |
| Xã Hùng Xuyên | Xã Chí Đám |
| Xã Hữu Đô (đã nhập từ 01/01/2020) | Xã Đoan Hùng |
| Xã Minh Lương (đã nhập từ 01/01/2025) | Xã Bằng Luân |
| Xã Minh Phú (đã nhập từ 01/01/2025) | Xã Chân Mộng |
| Xã Minh Tiến (đã nhập từ 01/01/2025) | Xã Chân Mộng |
| Xã Nghinh Xuyên (đã nhập từ 01/01/2020) | Xã Chí Đám |
| Xã Ngọc Quan | Xã Đoan Hùng |
| Xã Phong Phú (đã nhập từ 01/01/2020) | Xã Tây Cốc |
| Xã Phú Lâm | Xã Tây Cốc |
| Xã Phú Thứ (đã nhập từ 01/01/2020) | Xã Đoan Hùng |
| Xã Phúc Lai | Xã Bằng Luân |
| Xã Phương Trung (đã nhập từ 01/01/2020) | Xã Tây Cốc |
| Xã Quế Lâm (đã nhập từ 01/01/2020) | Xã Tây Cốc |
| Xã Sóc Đăng (đã nhập từ 01/01/2025) | Xã Đoan Hùng |
| Xã Tây Cốc | Xã Tây Cốc |
| Xã Tiêu Sơn (đã nhập từ 01/01/2025) | Xã Chân Mộng |
| Xã Vân Đồn (đã nhập từ 01/01/2025) | Xã Chân Mộng |
| Xã Vân Du (đã nhập từ 01/01/2025) | Xã Chí Đám |
| Xã Vụ Quang (đã nhập từ 01/01/2025) | Xã Chân Mộng |
| Xã Yên Kiện | Xã Chân Mộng |